Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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Shroom4Q1W617 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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Shroom4Q1W617 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Shroom4Q1W617 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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Shroom4Q1W617 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms