Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf3ip1Q149C2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Traf3ip1Q149C2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms