Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VgfQ0VGU4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms