Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc162pQ0VG85 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms