Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttc21bQ0HA38 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc21bQ0HA38 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms