Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cass4Q08EC4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cass4Q08EC4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms