Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
MitfQ08874 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms