Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tgm3Q08189 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms