Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh3bp2Q06649 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms