Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cab39Q06138 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cab39Q06138 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms