Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPINDOCQ05AH6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPINDOCQ05AH6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms