Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PtprgQ05909 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprgQ05909 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms