Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cxcr5Q04683 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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