Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RelaQ04207 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RelaQ04207 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RelaQ04207 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RelaQ04207 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RelaQ04207 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RelaQ04207 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms