Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pfdn6Q03958 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pfdn6Q03958 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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