Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddr1Q03146 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms