Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cacna1sQ02789 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cacna1sQ02789 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms