Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PrkcqQ02111 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PrkcqQ02111 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PrkcqQ02111 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PrkcqQ02111 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PrkcqQ02111 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PrkcqQ02111 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PrkcqQ02111 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PrkcqQ02111 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PrkcqQ02111 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PrkcqQ02111 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PrkcqQ02111 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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PrkcqQ02111 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PrkcqQ02111 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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