Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mc1rQ01727 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mc1rQ01727 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms