Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gja5Q01231 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms