Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col1a2Q01149 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col1a2Q01149 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms