Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gabpb1Q00420 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gabpb1Q00420 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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