Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gfra1P97785 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gfra1P97785 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms