Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pitx2P97474 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pitx2P97474 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms