Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smyd1P97443 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smyd1P97443 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms