Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pkp1P97350 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pkp1P97350 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pkp1P97350 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pkp1P97350 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pkp1P97350 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkp1P97350 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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