Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SeboxP70368 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SeboxP70368 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms