Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vamp3P63024 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vamp3P63024 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms