Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SnrpfP62307 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms