Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lmo4P61969 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lmo4P61969 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms