Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ube2d1P61080 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms