Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PlnP61014 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PlnP61014 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PlnP61014 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PlnP61014 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PlnP61014 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PlnP61014 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PlnP61014 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PlnP61014 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PlnP61014 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PlnP61014 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PlnP61014 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PlnP61014 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PlnP61014 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PlnP61014 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PlnP61014 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PlnP61014 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PlnP61014 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PlnP61014 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PlnP61014 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PlnP61014 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PlnP61014 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PlnP61014 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PlnP61014 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PlnP61014 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PlnP61014 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms