Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Paxbp1P58501 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Paxbp1P58501 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms