Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NcstnP57716 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NcstnP57716 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms