Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bace1P56818 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms