Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SmoP56726 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmoP56726 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmoP56726 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmoP56726 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmoP56726 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmoP56726 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SmoP56726 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmoP56726 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmoP56726 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmoP56726 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmoP56726 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmoP56726 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmoP56726 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmoP56726 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmoP56726 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmoP56726 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SmoP56726 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SmoP56726 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmoP56726 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmoP56726 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SmoP56726 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmoP56726 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmoP56726 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmoP56726 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmoP56726 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmoP56726 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmoP56726 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmoP56726 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmoP56726 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmoP56726 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmoP56726 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SmoP56726 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SmoP56726 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SmoP56726 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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