Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23aP54726 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms