Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacnb3P54285 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms