Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClgnP52194 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms