Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr5P51682 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr5P51682 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms