Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx3P50481 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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