Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpdP50404 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SftpdP50404 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SftpdP50404 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms