Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmod1P49813 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmod1P49813 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms