Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CitP49025 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CitP49025 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CitP49025 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CitP49025 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CitP49025 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CitP49025 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms