Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd1P48410 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms