Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rfx2P48379 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfx2P48379 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms