Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tnfsf9P41274 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tnfsf9P41274 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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