Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VhlP40338 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
VhlP40338 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
VhlP40338 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
VhlP40338 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms