Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ThpoP40226 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
ThpoP40226 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ThpoP40226 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ThpoP40226 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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