Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Notch4P31695 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch4P31695 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch4P31695 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch4P31695 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch4P31695 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch4P31695 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch4P31695 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch4P31695 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch4P31695 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch4P31695 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch4P31695 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch4P31695 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Notch4P31695 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms